A Cobrape está atuando junto ao Instituto Taquari Vivo para estruturar o Programa Pantanal Sustentável na Bacia do Alto Paraguai (BAP), localizada na Região Hidrográfica do Paraguai. A iniciativa visa promover o desenvolvimento sustentável nas planícies pantaneiras e planaltos adjacentes, melhorando a infraestrutura e incentivando a preservação ambiental e os sistemas agrícolas conservacionistas, resilientes e adaptados às mudanças climáticas.    

Para isso, a Cobrape trabalha na organização e sistematização de dados e informações, levantamentos, estudos técnicos, pesquisas e documentos sobre o tema. O objetivo é contribuir para a melhoria da governança territorial e a articulação entre instituições governamentais e não governamentais, população local e outras partes interessadas; criar uma base de informações e monitoramento territorial dos aspectos ambientais, econômicos e sociais; melhorar a infraestrutura local, reduzindo os riscos ambientais da interferência humana na região e melhorando a viabilidade da pecuária e do turismo sustentáveis; recuperar as sub-bacias prioritárias, reduzindo processos erosivos e assoreamento dos rios, por meio da melhoria constante das práticas agrícolas e da recuperação de pastagens e vegetação nativa degradada; promover sistemas agrícolas resilientes, adaptados às mudanças do clima e que promovam a segurança alimentar, evitando a degradação ambiental e produtiva, com a adoção de boas práticas agropecuárias e sistemas com baixas emissões de gases de efeito estufa, sobretudo nas médias propriedades e na agricultura familiar; e aumentar a proteção da biodiversidade na planície pantaneira e nos planaltos da BAP. 

O Programa Pantanal Sustentável terá sua atuação no estado de Mato Grosso do Sul, sob coordenação do Secretaria de Estado de Meio Ambiente, Desenvolvimento, Ciência e Tecnologia (Semadesc).